Após a realização da biópsia ambulatorial ou cirúrgica, as amostras são encaminhadas ao médico Patologista para realizar a análise anatomopatológica, a qual irá dar o diagnóstico da lesão. O Exame Anatomopalógico (AP) consiste na avaliação macroscópica e microscópica de células e tecidos, permitindo diagnosticar o tipo de lesão (benigna ou maligna) e suas características.
Após o diagnóstico de malignidade, ou nos casos inconclusivos na análise anatomopatológica inicial, complementa-se o diagnóstico avaliando a “biologia” da lesão, ou seja, a expressão de proteínas, geralmente receptores celulares. Através dessa análise de proteínas podemos diferenciar lesões malignas de benignas, assim como avaliar melhor as características dos tumores malignos, orientando o tratamento e o prognóstico. Essa análise é feita através do exame chamado Imuno-histoquímica. Não é necessário coleta de novo material – do mesmo material enviado para o exame anatomopatológico realiza-se o exame Imuno-Histoquímico.